魔術師として活躍し、魔大陸を救った過去を持つ少女クラウディア。 彼女は幼い頃に生き別れた妹の行方を追って、とある教団へ潜入する。 はたしてクラウディアは、 無事に妹を見つけることができるだろうか。

天使ザラキエルは教団に囚われた仲間を助けるべく奮闘するが、 聖女を名乗る少女に力を奪われて敗北……。 数週間後、ゴミ同然に捨てられて解放されたザラキエルは教団に復讐を決意するが、 運命が大きく動き出していたことを知らなかった。

天使によって世界が滅び、半年―― 魔術師クラウディアは一通の手紙を受け取り、魔大陸へ向かっていた。 そこで天使と遭遇し、神器の力を得て撃退したのだが、 ある任務で氷漬けの神獣を発見したことで、大きな運命へと巻き込まれていくこととなる。

冒険者に憧れている若き少女「シィル」が開拓島アレーティアを訪れたことで、物語が幕を開ける。 緑の平原、広大な海、火山、古くから眠る膨大な遺跡の数々。 シィルは、ときに戦い、ときに仲良くなったヒロインたちと平和な日々を過ごしていく。 しかし…